A Paróquia Sagrado Coração de Jesus foi a segunda de Joinville. A pedido do Pe. José Sundrup ao então bispo da Diocese de Florianópolis, dom Joaquim de Oliveira, em 21 de dezembro de 1916, a Paróquia Sagrado Coração de Jesus era desmembrada da Paróquia São Francisco Xavier (hoje Catedral Diocesana). Embora o Pe. José Sundrup, no início de 1917, tenha recebido provisão de vigário paroquial para as duas paróquias, quem de fato iniciou as funções de vigário foi o Pe. Augusto Weicherding, scj, sendo a mesma confiada a ele oficialmente em 4 de maio de 1917, quando então, a Paróquia passou a ser administrada pelos padres-religiosos da Congregação dos Padres do Sagrado Coração de Jesus (dehonianos). Sem um templo e moradia, Pe. Augusto instalou-se no Asilo de Órfãos e Desvalidos de Joinville (hoje Lar Abdon Batista). Foram dados à capela do Asilo todos os direitos e privilégios de Paróquia, com os atendimentos paroquiais e as celebrações dominicais. É ali que se inicia a história deste Santuário.
Em 20 de agosto de 1917, foi autorizada a compra de um terreno de 25 metros, situado nas esquinas das ruas Inácio Bastos e São Paulo, que se juntaria ao terreno doado pela Sra. Francisca Schneider, para construir a capela provisória. A imagem do Sagrado Coração de Jesus chegou em 1919, quando iniciaram os trabalhos do Apostolado da Oração e das Filhas de Maria.
Já constituída como matriz, o Natal de 1940 foi celebrado na nova igreja que ainda precisaria ser finalizada. A construção da torre que abrigaria os seis sinos iniciou em 1957, durando dois anos. Em 1963, o Pe. Érico Ahler, scj, assumiu como pároco e em 1965 a Paróquia ganhou sua primeira comunidade: São Judas Tadeu, no Itaum. Já em 1967 a comunidade paroquial celebrou o cinquentenário e a ordenação do primeiro paroquiano, Pe. José Chafi Francisco, também conhecido como Monsenhor Juca. Entre 1968 e 1970 foram retomadas as obras da Casa Paroquial e concluída a construção do Centro Comunitário. Neste mesmo período foi instalada a Sacristia e os vitrais. Em 1973 chegaram a Joinville os restos mortais do primeiro pároco, Pe. Augusto, sepultados na igreja até os dias de hoje. Em 1980 foi constituída a Comunidade Divino Espírito Santo, no Petrópolis, e em 1982 foi criada a Comunidade Nossa Senhora do Rosário, no Guanabara.
A primeira Assembleia Paroquial aconteceu 1983 e contou com a participação de 62 agentes. A partir disso, foi formada a equipe de Liturgia, Conselho Paroquial de Pastoral e Ação Social. Em 1985 foi criado o estacionamento de veículos. A imagem de Nossa Senhora de Fátima, vinda de Portugal, passou pela paróquia em 1988, reunindo mais de seis mil fiéis, e um ano depois foi demolido o antigo galpão da Paróquia, que deu lugar ao atual Centro Comunitário. Em 10 de agosto de 1990 a Paróquia ficou completa com a fundação da Comunidade Sagrada Família, no Guanabara.
Em 1994, com a chegada do novo pároco, Pe. Antônio Wagner da Silva, scj, a Paróquia assume o programa “A caminho da luz” durante a madrugada na Rádio Difusora, hoje Arca da Aliança. Em 1997 é celebrado os 80 anos da presença dehoniana em Joinville.
Um novo capítulo da história da Paróquia Sagrado Coração de Jesus começa a ser escrito em 30 de junho de 2000, com a criação do primeiro santuário de Joinville. A missa solene, que elevou a segunda paróquia da cidade a santuário, foi presidida por dom Antônio Wagner da Silva, scj, bispo da Diocese de Guarapuava, no Paraná, e concelebrada por dom Orlando Brandes, à época bispo da Diocese de Joinville. Em 2006, celebraram-se os 90 anos da Paróquia, com a participação de diversos padres que passaram por Joinville. Entre 2007 e 2010, mais uma série de melhorias foram realizadas.
O ano de 2014 marcou um novo tempo na Paróquia Santuário Sagrado Coração de Jesus, quando deixou de ser responsável pelas Comunidades São Judas Tadeu, Nossa Senhora do Rosário, Sagrada Família e Divino Espírito Santo. A partir de então, a Paróquia assumiu plenamente sua missão de santuário, como local de peregrinação, fé e devoção ao Sagrado Coração de Jesus.
Entre 2014 e 2015, uma nova reforma, em preparação às celebrações do Centenário: troca do piso e nova pintura da igreja, construção da Gruta de Nossa Senhora Aparecida, revitalização do jardim e do estacionamento. Em 2016, nas celebrações do Centenário e do Ano Santo da Misericórdia, o Santuário abriu sua Porta Santa, sendo local de peregrinação e recebimento de indulgências, na 1ª sexta-feira do mês – Dia devocional ao Sagrado Coração de Jesus.


ORAÇÕES DEVOCIONAIS
Consagração ao Sagrado Coração de Jesus
“Coração de Jesus, Tu és a fonte do amor, da vida e da santidade. No Teu Coração, somos chamados a beber da fonte da Salvação, a experimentar a verdadeira paz e alegria, a fortalecer a nossa vocação e a participar do Teu amor solidário. Nós Te louvamos, porque sempre nos chamas para mais perto do Teu Coração e n’Ele nos ofereces um abrigo seguro onde descansar. Por isso, com alegria, acolhemos o Teu convite, “vinde a Mim”. Com o sincero desejo de viver e testemunhar o Teu amor, aqui estamos para consagrar nossa vida ao Teu Sagrado Coração e confiar à Tua proteção nossas comunidades, nossos projetos e trabalhos. Que o sangue e a água que jorram do Teu Coração, nos deem um coração novo para servir com gratuidade os nossos irmãos e irmãs. Amém.”


OFERECIMENTO DO DIA AO SAGRADO CORAÇÃO DE JESUS
“Ó Jesus, o Teu lado aberto é abrigo seguro e fonte de Água Viva que nossos corações tanto procuram. Transforma, fortalece e conforta nossa vida que oferecemos e consagramos no Altar do Teu Coração. Aceita e abençoa nossa mente e coração, nossas famílias e amizades, nossos estudos, divertimentos e trabalhos. Aquece nossos corações, para que atraídos e impelidos pelo Teu amor nos tornemos discípulos missionários do Teu Coração. Que no decorrer deste dia, cada gesto, palavra e atitude nossa, faça o nosso coração bater no ritmo do Teu Coração. Amém.”


CONSAGRAÇÃO DAS FAMÍLIAS AO SAGRADO CORAÇÃO DE JESUS
“Ó Coração Divino, nós Te louvamos e Te bendizemos, porque no berço de Nazaré, assumistes e consagrastes a família humana. Somos agradecidos porque nos chamastes a participar deste santuário sagrado: a nossa família. Movidos pelo desejo de seguir-Te, consagramos as nossas famílias ao Teu Divino Coração. Abençoa, ampara, guarda e protege nossos pais, mães e filhos. Ensina-nos a semear a fraternidade e promover a vida. Nos momentos de dificuldade, sê nosso abrigo seguro, colo do Bom Pastor e ombro amigo. Que sob o olhar da Família de Nazaré, nossas famílias aprendam a ser santuário de vida, ternura e amor, lugar de partilha e perdão, escola de fé e comunhão de solidariedade. Amém.”